Администрация ЭМР является исполнительно-распорядительным органом муниципального района, который наделен полномочиями по решению вопросов местного значения и полномочиями для осуществления отдельных государственных полномочий, переданных органам местного самоуправления федеральными законами и законами Эвенкийского автономного округа, Красноярского края.
Администрация района подотчетна районному Совету депутатов.